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Bacillus xylanase gene的DNAMAN引物设计

更新时间:2011-5-15:  来源:毕业论文

Bacillus xylanase gene的DNAMAN引物设计
设计(论文)的主要内容(技术指标)与要求:
主要内容:  在NCBI 上搜索相关基因,用DNAMAN软件设计引物。
要求: 熟练引物设计的要求和步骤,能成功设计引物。

一、立题依据(国内外研究进展或选题背景、研究意义等)
在整个PCR体系中, 引物占有十分重要的地位。PCR的特异性要求引物与靶DNA特异结合,不与其他非目的DNA结合,PCR的灵敏性要求DNA聚合酶能对引物进行有效的延伸,可见引物设计好坏与PCR结果密切相关。把设计好的两条引物用于杆菌木聚糖酶基因的PCR,用凝胶电泳检测扩增结果,以判断引物设计的好坏。

二、研究的主要内容及预期目标
     能熟练使用NCBI和DNAMAN软件设计引物,能成功设计芽孢杆菌属木聚糖酶基因的引物。
三、研究方案(思路)
1 序列查找原文请找腾讯752018766六,维-论'文.网http://www.lwfree.cn
2系列同源性比较
3引物设计筛选及设计结果
四、论文进度安排
1、查阅相关资料                                           3月10号—4月10号
2、学会使用NCBI查找基因序列和DNAMAN软件设计引物     4月10号—4月30号
3、设计杆菌属木聚糖酶基因的引物                           4月30号—5月15号
4、论文写作及修改                                         5月15号—5月25号
5、论文答辩                                               6月2号
目录
摘要1
关键词1
Abstract 1
Key word1
引言1
1引物设计基本原则2
2引物设计步骤及结果3
3讨论3
参考文献3
致谢4
  生物工程专业学生     杨兴东
                        指导教师           孙迅

摘要:在NCBI上搜索Bacillus xylanase gene, 借助DNAMAN软件设计引物。
关键词:NCBI, 芽孢杆菌属木聚糖酶基因, DNAMAN软件
                    
Primers design of xylanase gene in Bacillus
Student majoring in Biotechnology       Yang Xing dong
   Tutor                        Sun xun

Abstract :In the NCBI search Bacillus xylanase gene, primers were designed using DNAMAN Software
Key word:NCBI, Bacillus xylanase gene, DNAMAN Software

引言原文请找腾讯752018766六,维-论'文.网http://www.lwfree.cn
木聚糖酶在自然界分布相当广泛,在海洋及陆地细菌、海洋藻类、真菌和反刍动物瘤胃、蜗牛、甲壳动物、陆地植物组织和各种无脊椎动物中都存在。已报道的能产木聚糖酶的微生物有细菌、链霉菌、曲霉、青霉和木霉等,人们研究和应用最多的是细菌、曲霉和木霉所产的木聚糖酶。由于其在造纸、食品和饲料等行业中潜在的应用前景,近年来越来越多的研究者对它进行了广泛而深入的研究。[7]本论文工作主要是尝试设计用于PCR扩增芽孢杆菌属木聚糖酶基因的引物。
1 引物设计基本原则[9]
    PCR引物设计的目的是找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。引物的优劣直接关系到PCR的特异性及成功与否。对引物的设计不可能有一种包罗万象的规则确保PCR的成功,但遵循某些原则,将有助于引物的设计。
①应用核酸序列保守区设计并具有特异性
    设计引物之前,必须分析待测靶序列的性质,选择高度保守、碱基分布均匀的区域进行引物设计。引物与非特异扩增序列的同源性不要超过70%或有连续8个互补碱基同源。
②避开产物的二级结构区
某些引物无效的主要原因是引物重复区DNA二级结构的影响,选择扩增片段时最好避开二级结构区域。用有关计算机软件可以预测估计mRNA的稳定二级结构,有助于选择模板。1833

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