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山羊肌肉差异表达miRNA基因多态性分析

时间:2019-04-13 14:32来源:毕业论文
以徐淮山羊、波尔山羊和海门山羊等三个品种共计135个个体为材料,主要利用PCR-SSCP技术,经过①DNA的提取、浓度测定; ②定点扩增DNA序列;③扩增产物聚丙烯按凝胶电泳及染色

摘要:本研究以徐淮山羊、波尔山羊和海门山羊等三个品种共计135个个体为材料,主要利用PCR-SSCP技术,经过①DNA的提取、浓度测定; ②定点扩增DNA序列;③扩增产物聚丙烯按凝胶电泳及染色;④自动成像、基因型判定等操作,对山羊19个肌肉发育相关的重要miRNA进行遗传变异研究,最终发现仅有miR-424-5p、miR-411-5p、NovelmiR-47、miR-541-3p和miRNA-767等其中5个基因座具有多态性。本研究中,多态信息含量在三个品种中的分布是一致的,只是在不同位点有所不同。除miRNA-411c-3p为低度多态外,其它4个变异位点均为中度多态。同时,在五个多态基因座中,三个山羊品种的大部分位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,仅有Novel miR-47和miR-767在海门山羊和波尔山羊以及miR-541-3p在波尔山羊的上处于Hardy-Weinberg非平衡状态。在本研究中,miR-411-5p和miR-767只检测到两种带型,即AA型和AB型,没有BB纯合型。34460
毕业论文关键词:DNA提取,PCR,SSCP,测序,多态性
Ploymorphism analysis of miRNA gene’s differential expression in goat muscle
Abstract: We had three varieties of goats to conduct the study . They are Xuhuai goat (XH , n=45) , Boer goat (BE , n=45) and Haimen goat (HM , n=45) . The technique of PCR-SSCP was taken to do the research about genetic variation on 19 miRNAs related to the development of muscle . Finally , we found that there are only 5 of them indicated ploymorphism , and they are miR-424-5p、miR-411-5p、NovelmiR-47、miR-541-3p and miRNA-767 . In this study , polymorphicsm information content turned to be accordant , just various at various loci . Apart from miRNA-411c-3p low polymorphism, the other 4 loci are medium polymorphism . At the same time, in the five polymorphic loci , most loci of the three varieties were in Hardy-Weinberg equilibrium, only Novell miR-47 and miR-767 in Haimen goat and Boer goat and miR-541-3p in Boer goat in Hardy Weinberg non-equilibrium state. In this study, miR-411-5p and miR-767 was detected with two type , AA type and AB type , but no BB type. 源自$六l维,论:文w网)加7位QQ3249^114 www.lwfree.cn
Key words: DNA extraction , PCR , SSCP , oder-checking , polymorphism
目录
1 引言    1
2 实验材料    2
2.1 实验动物及血样来源    2
2.2 实验试剂    2
2.3 仪器设备    2
3 试验方法    2
3.1 羊全血基因组DNA的提取    2
3.2 PCR反应所需引物设计    2
3.3 PCR-SSCP DNA标记分析    3
3.4 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物    4
3.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳和检测    4
3.6 测序    4
3.7 统计分析方法    4
4 结果与分析    4
4.1 基因组DNA样品检测    4
4.2 候选miRNA遗传变异检测    4
4.2.1 NovelmiR-47基因遗传变异检测    5
4.2.2 miR-541-3p基因遗传变异检测    6
4.3 候选基因多态基因座的群体遗传学分析    7
4.3.1 NovelmiR-47前体基因群体遗传结构分析    7
4.3.2 miR-541-3p前体基因群体遗传结构分析    8
5 讨论    9
致谢    10
参考文献    10
1 引言
    基因多态性在个体的繁殖过程中演绎了一个十分重要的角色,其导致了转录和翻译的多样性,这一特征十分有利于同时保证遗传的准确性与宽容度,这对于生物界的稳定和多样化起到了至关重要的作用。miRNA是一类非编码单链小RNA,其长度大约为21~23nt,它们在进化上相对保守。miRNA通过靶向mRNA来使其降解,或抑制其翻译,进而阻止靶蛋白形成。miRNA在各项生物学过程中发挥着重要的调节作用,并且在许多疾病中也都发现了miRNA的异常表达,由此也说明,基因的多态性与各种疾病有着密不可分的联系。 山羊肌肉差异表达miRNA基因多态性分析:http://www.lwfree.cn/shengwu/20190413/31966.html
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